日本航空(JL)、日本エアシステム(JD)、JALウェイズ(JO)は7月以降の国際線路線便数計画を変更し、国土交通省に申請した。既に4月から6月にかけて減便、運休などの措置を講じているが、SARSに関しては世界保健機構(WHO)や外務省の危険情報の変動を受けて一部路線で運航を再開する。例えば、東京／チューリッヒ線の運休を週7便の運航とするほか、東京／香港線では現在の週7便を7月1日から週14便で運航、大阪／グアム線、大阪／サイパン線のそれぞれ週7便を経路変更し、大阪／グアム／サイパン／大阪で週7便運航とする。なお、大阪／北京線は今回、新たに運休する。
　JALグループの路線計画概要は下記の通り。

▽減便・運休から復便する主な路線(路線　変更後便数／開始日／現行便数)
東京／香港線　週14便／7月1日／ 週7便
東京／ロサンゼルス線　週8便／7月15日／週7便
東京／チューリッヒ線　週7便／6月28日／運休
東京／ホノルル線　週21便／7月15日／週7便
大阪／ホノルル線　週14便／7月15日／週7便
名古屋／バンコク線　週4便／7月1日／週2便

▽経路変更
大阪／グアム／サイパン／大阪線　週7便／7月15日〜7月31日
※大阪／グアム線、大阪／サイパン線のそれぞれ週7便から変更

▽増便
名古屋／東京／ニューヨーク／サンパウロ線
　週3便／7月1日〜8月31日／週1便
※現在、週3便を運航する東京／ニューヨーク／サンパウロ線の2便を名古屋／成田間を延長

▽減便(路線　変更後便数／期間／現行便数)
東京／ロンドン線　週10便／7月15日〜8月31日／週13便
東京／パリ線　週8便／7月15日〜8月31日／週10便
東京／上海線　週14便／7月15日〜8月31日／週16便
東京／ソウル線　週14便／7月15日〜8月31日／週21便
大阪／ロンドン線　週5便／7月1日〜8月31日／週7便
大阪／パリ線　週2便／7月1日〜8月31日／週4便
大阪／ホーチミン線　週2便／7月1日〜7月14日／週3便
名古屋／上海線　週5便／7月15日〜8月31日／週7便

▽運休(路線　期間／現行便数)
東京／上海線(JD)　7月15日〜8月31日／週5便
東京／西安線(JD)　7月15日〜8月31日／週2便
大阪／北京線　7月1日〜7月14日／週7便
大阪／広州線(JD)　7月15日〜7月31日／週2便
大阪／広州線(JD)　8月1日〜8月31日／週3便
大阪／昆明線(JD)　7月15日〜8月31日／週2便
大阪／グアム線　7月15日〜7月31日／週7便
大阪／サイパン線　7月15日〜7月31日／週7便
福岡／香港線　7月15日〜8月31日／週7便
福岡／上海線　7月15日〜8月31日／週7便
名古屋／北京線　7月15日〜8月31日／週5便